Кафедра «Прикладная математика и информатика» была образована  1 июля 2003 года согласно приказа № 132 от 17.06.03 на базе кафедр «Информационные системы в экономике» и «Высшая математика». Создание кафедры было продиктовано стремительным  развитием компьютерной техники и информационных технологий в целом, и необходимостью единого концептуального подхода преподавание дисциплин с учетом современных достижений в области технического и программного обеспечения в частности.

За время своего сущетсования претерпела значительные изменений в кадровом составе.

В период с 2003 по 2014 год кафедру «Прикладная математика и информатика» возглавлял кандидат физико-математических наук, доцент Хребет Валерий Григорьевич.